cati-bbric

• Bioinformatique pour les chercheurs en biologie : le CATI BBRIC organise une réunion d'information le mardi 16 avril 2013 (10h-16h30)
  • Présentation
  • Relevé de conclusions/perspectives
• Bioinformatique pour les chercheurs en biologie : le CATI BBRIC organise une session de formation les 24 et 25 avril 2014 à Paris
  • Présentation
  • Compte rendu/perspectives
• Bioinformatique pour les chercheurs en biologie : le CATI BBRIC organise une session de formation les 28 et 29 avril 2015 à Paris
  • Présentation
  • Compte rendu/perspectives
• Bioinformatique pour les chercheurs en biologie : le CATI BBRIC organise une session de formation les 19 et 20 avril 2016 à Paris
  • Présentation
  • Compte rendu/perspectives

Inscription liste de diffusion "communauté BBRIC"

Les protocoles d'analyses mis à disposition de la "communauté BBRIC" (dernière mise à jour le 4 mai 2016)

Normes de programmation

Configuration ChadoApolloGbrowse

BigWigGbrowse

BenchPerl

Mise en place d'une architecture avec réplication automatique basée sur iRods

Galaxy

• Institut de Recherche en Horticulture et Semences - IRHS : Martial Briand (SPE)

• Abeilles et Environnement - AE : Nicolas Morison (SPE)

• Biologie du fruit & Pathologie - BFP: Thierry Candresse (SPE, Responsable Scientifique), Virginie Garcia (BAP), Sébastien Thiel (SPE)
• Santé et Agroecologie du Vignoble - SAVE : Alain Blancard (SPE)

• Laboratoire des Symbioses Tropicales et Mediterranéennes - LSTM : Marc Tauzin (SPE), Stefano Collela (SPE)
• Biochimie et physiologie moléculaire des plantes - B&PMP: Cecile Fizames (BAP)
• Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes-Insectes - DGIMI: Imene Seninet (SPE)
• Centre de Biologie et de Gestion des Populations - CBGP: Franck Dorkheld (SPE), Alexandre Dehne Garcia (SPE), Bernhard Gschloessl (SPE), Sylvain Piry (SPE)

• Biologie Fonctionnelle Insectes et Interactions - BF2I: Patrice Baa-Puyoulet (SPE), Hubert Charles (INSA Lyon)

• Agroécologie : Samuel Mondy (SPE)

• Zoologie Forestière : Régis Phélut (EFPA)

• Institut de Génétiques, Environnement et Protection des Plantes - IGEPP: Anthony Bretaudeau (SPE), Jean-Pierre Gauthier (SPE), Lucie Mieuzet (SPE), Fabrice Legeai (SPE), Olivier Filangi (BAP), Stephanie Robin (SPE), Susete Alves-Carvalho (SPE)

• Institut Sophia Agrobiotech - ISA: Etienne Danchin (SPE), Martine Da Rocha (SPE), Emeline Deleury (SPE), Corinne Rancurel (CNRS)

• Institute of Plant Sciences Paris-Saclay - IPS2 : Joseph Tran (BAP)

• Laboratoire des Interactions Plantes-Microorganismes - LIPM: Sébastien Carrere (SPE), Ludovic Cottret (SPE), Jérôme Gouzy (SPE), Ludovic Legrand (SPE), Erika Sallet (SPE)

• Biologie, gestion des risques en agriculture - Champignons pathogènes des plantes - BIOGER: Adeline Simon (SPE), Alain Le Berre (SPE)

• Christine Gaspin, Responsable de la Cellule Bioinformatique INRA

Intranet

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hom_cati_bbric.zip

gouzy_archivedonneesinra_201208010-2mo.pdf

gouzy_bbric-archivedonnees_20130226.pdf