User Tools

Site Tools


benchshortreadassemblerprogramsaug2009

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
benchshortreadassemblerprogramsaug2009 [2009/08/26 15:52]
gouzy
benchshortreadassemblerprogramsaug2009 [2010/03/17 08:13] (current)
gouzy
Line 1: Line 1:
-==== EN COURS (fin prévue pour aout) mais je n'ai pas dis qu'​elle année! ==== 
  
-====== Data ======+== Test velvet 0.7.61 / oases 0.1.07, mars 2010 ==
  
-====== Summary ====== +Donnees de testespece Medicago; 1 lane solexa de 41505156 de reads pair-end (~2x20M); insert ~200; longueur 2x54; ces mêmes données ont été rabotées a 38nt.
- +
-^ Features ​     ^  edena   ​^ ​         ssake              ^         ​velvet ​                 ^   ​abyss ​  ​^ ​ vcake ^ mira ^ +
-| url           | http://​www.genomic.ch/​edena.php ​ |  http://​www.bcgsc.ca/​platform/​bioinfo/​software/​ssake | http://​www.ebi.ac.uk/​~zerbino/​velvet/ ​ |  http://​www.bcgsc.ca/​platform/​bioinfo/​software/​abyss ​ |  +
-| version ​      ​| ​   |                         ​| ​    ​| ​     | +
-| publication ​  ​| ​ ?     | Warren RL,  2007  Bioinformatics. 23:500-501.   ​| ​ ?    | Simpson JT Genome Res. 2009 June; 19(6): 1117–1123|+
  
benchshortreadassemblerprogramsaug2009.txt · Last modified: 2010/03/17 08:13 by gouzy